Publications
Information about journal articles, updated at 02-03-2025, from platform CIÊNCIAVITAE.
Designer high-density lipoprotein particles enhance endothelial barrier function and suppress inflammation
Yueh-Chien Lin; Steven Swendeman; Irina Moreira; Avishek Ghosh; Andrew Kuo; Nícia Rosário-Ferreira; Shihui Guo; et al, Science Signaling. 2024. http://dx.doi.org/10.1126/scisignal.adg9256 . 10.1126/scisignal.adg9256 . Science Signaling
Advancing Drug Safety in Drug Development: Bridging Computational Predictions for Enhanced Toxicity Prediction
Ana M. B. Amorim; Luiz F. Piochi; Ana T. Gaspar; António J. Preto; Nícia Rosário-Ferreira; Irina S. Moreira, Chemical Research in Toxicology. 2024. https://doi.org/10.1021/acs.chemrestox.3c00352 . 10.1021/acs.chemrestox.3c00352 . Chemical Research in Toxicology
SARS-CoV-2 Membrane Protein: From Genomic Data to Structural New Insights
Catarina Marques-Pereira; Manuel N. Pires; Raquel P. Gouveia; Nádia N. Pereira; Ana B. Caniceiro; Nícia Rosário-Ferreira; Irina S. Moreira, International Journal of Molecular Sciences. 2986 - 2986. 6. 23. 2022. https://doi.org/10.3390/ijms23062986 . 10.3390/ijms23062986 . International Journal of Molecular Sciences
Network biology and artificial intelligence drive the understanding of the multidrug resistance phenotype in cancer
Bueschbell, Beatriz; Caniceiro, Ana Beatriz; Suzano, Pedro M.S.; Machuqueiro, Miguel; Rosário-Ferreira, Nícia; Moreira, Irina S., Drug Resistance Updates. 60. 2022. http://dx.doi.org/10.1016/j.drup.2022.100811 . 10.1016/j.drup.2022.100811 . Drug Resistance Updates
Using machine-learning-driven approaches to boost hot-spot's knowledge
Nícia Rosário-Ferreira; Alexandre M. J. J. Bonvin; Irina S. Moreira, WIREs Computational Molecular Science. 2022. https://doi.org/10.1002/wcms.1602 . 10.1002/wcms.1602 . WIREs Computational Molecular Science
The Treasury Chest of Text Mining: Piling Available Resources for Powerful Biomedical Text Mining
Nícia Rosário-Ferreira; Catarina Marques-Pereira; Manuel Pires; Daniel Ramalhão; Nádia Pereira; Victor Guimarães; Vítor Santos Costa; Irina Sousa Moreira, BioChem. 60 - 80. 2. 1. 2021. https://doi.org/10.3390/biochem1020007 . 10.3390/biochem1020007 . BioChem
SicknessMiner: a deep-learning-driven text-mining tool to abridge disease-disease associations
Rosário-Ferreira, Nícia; Guimarães, Victor; Costa, Vítor S.; Moreira, Irina S., BMC Bioinformatics. 1. 22. 2021. http://dx.doi.org/10.1186/s12859-021-04397-w . 10.1186/s12859-021-04397-w . BMC Bioinformatics
In Silico End-to-End Protein–Ligand Interaction Characterization Pipeline: The Case of SARS-CoV-2
Nícia Rosário-Ferreira; Salete J. Baptista; Carlos A. V. Barreto; Filipe E. P. Rodrigues; Tomás F. D. Silva; Sara G. F. Ferreira; João N. M. Vitorino; et al, ACS Synthetic Biology. 2021. https://doi.org/10.1021/acssynbio.1c00368 . 10.1021/acssynbio.1c00368 . ACS Synthetic Biology
The Central Role of Non-Structural Protein 1 (NS1) in Influenza Biology and Infection
Nícia Rosário-Ferreira; António J. Preto; Melo R.; Irina Moreira; Rui M. M. Brito, International Journal of Molecular Sciences. 2020. https://www.mdpi.com/1422-0067/21/4/1511 . 10.3390/ijms21041511 . International Journal of Molecular Sciences
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All projects
Information of exclusive responsibility of the researcher 02-03-2025 , from platform CIÊNCIAVITAE.
2022/12/01 - 2023/11/30
Molecular-level understanding of receptor binding of engineered high-density lipoprotein particles that chaperone bioactive lipid mediator sphingosine 1-phosphate (S1P)
MCB220005P
Researcher
2021/02/01 - 2024/01/31
Descoberta do Interactoma vírus-hospedeiro: uma abordagem guiada por AI e dados multi-ómicos <br>
DSAIPA/DS/0118/2020
Other
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular; CNC.IBILI; Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa; Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento
Funders: Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2018/06/15 - 2021/12/14
Aplicação de Deep Learning ao processo de investigação de novas drogas anticancerígenas
PTDC/CCI-BIO/31356/2017
Other
Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular; Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Tecnologia e Ciência
Funders: Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2018/09/03 - 2022/03/04
Proteínas Membranares - desenvolvimento de novas técnicas de modelação computacional e sua aplicação ao estudo dos recetores acoplados a proteína G
PTDC/QUI-OUT/32243/2017
Other
Associação do Instituto Superior Técnico para a Investigação e Desenvolvimento; Universidade de Coimbra Centro de Neurociências e Biologia Celular
Funders: Fundação para a Ciência e a Tecnologia
2018/08/01 - 2021/07/31
Novos antivirais contra Influenza: validação do alvo NS1 e descoberta de compostos líder
PTDC/QUI-OUT/32572/2017
Other
Universidade de Coimbra
Funders: Fundação para a Ciência e a Tecnologia
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